Jeżeli dodaliśmy już naszą domenę możemy dokonać zmian w jej ustawieniach - np. wybrać domenę domyślną (katalog public_html w głównym drzewie katalogów będzie kierował do niej), włączyć lub wyłączyć obsługę połączenia szyfrowanego SSL lub zmienić nazwę domeny, czy też wersję PHP, która będzie używana do działania strony. W tym celu klikamy w link "Konfiguracja domen" w panelu DirectAdmin - otworzy nam się okno z listą podpiętych do konta domen.
Można tam dodać/usunąć domenę, zmienić nazwę istniejącej. Uwaga! Usuwając domenę - skasowane zostaną również wszystkie usługi dotychczas dodane dla tej domeny: strony, konta pocztowe itp.
Aby przejść do ustawień wybranej domeny klikamy w jej nazwę.
Formularz ustawień podzielony jest na 3 sekcje: